Em cinco séculos de história recente, pelo menos, inúmeros foram os acontecimentos que provocaram o afundamento de embarcações de todos os tipos no estuário do porto e na baía de Santos: tempestades, ataques piratas, incêndios, colisões etc.

Algumas dessas embarcações foram logo retiradas, como diversos rebocadores e barcaças; algumas foram abandonadas, como catraias de pescadores; outras ficaram longos anos submersas ou semi-submersas, enquanto infindáveis trâmites burocráticos ocorriam, como o Ais Georgius; outros são visitados por mergulhadores, por curiosidade ou em busca de objetos antigos porventura ainda existentes, como no caso de algumas caravelas.

Além das embarcações, também aeronaves se acidentaram sobre as águas do porto, bondes foram jogados ao mar, automóveis caíram de ferry-boats... as pesquisas para o aprofundamento do porto encontrarão muitos outros objetos afundados nas águas santistas. São estas as histórias aqui relatadas: