Em 1563, acompanhou Manuel da Nóbrega a Iperoig, a fim de tentar a paz com os Tamoios, lá ficando detido durante quatro meses como refém. À falta de papel e tinta, escreveu, nas areias de Iperoig, o famoso poema à Virgem, com 4.072 versos latinos, guardando-os de memória para reproduzi-los no papel quando tornasse a São Vicente. O venerável José de Anchieta, o grande catequizador, Apóstolo do Brasil, reitor do Colégio de São Vicente, envelhecido e alquebrado pelo trabalho, morreu a 9 de junho de 1597 na aldeia de Biritiba, hoje Anchieta, no Espírito Santo. O processo de sua canonização, inciado em 1620, só teve solução no século XXI.