O Instituto de Pesquisas e Estudos Florestais (Ipef) e o Departamento de Ciências Florestais da Esalq/USP firmaram uma parceria com o International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI) para criar uma página na Internet que disponibilize um banco de dados de uso simplificado (user friendly) de genes de plantas passíveis de serem usados como marcadores moleculares. 

Coordenado por Marcelo C. Dornelas, pesquisador realizando pós-doutoramento no Departamento de Ciências Florestais da Esalq, o projeto peneirará os genes que já estão nos bancos de dados públicos e que seriam de algum interesse no uso como marcadores moleculares, no melhoramento de espécies florestais. “Já existem nos bancos de dados seqüências de genes suficientes para se começar o entendimento do funcionamento das plantas e para serem usadas como ferramentas no melhoramento”, explica Dornelas. 

Testes de melhoramento baseados em marcadores moleculares têm sido usados para acelerar os processos de colocar uma característica, um gene de interesse, num germoplasma, num material, numa variedade de alta produção. Mais recentemente estratégias baseadas em técnicas de genômica para descoberta de genes, conjugadas com um processo de produção, obtenção de plantas transgênicas eficientes, e a miniaturização e a automação de ensaios e experimentos funcionais e também de sequenciamento, principalmente por seqüenciadores mais potentes, aceleraram a identificação de produtos candidatos - genes passíveis de uso no melhoramento de campo. 

Era pós-genômica - “Bancos de dados com informações de genômica já estão disponíveis e são parte indispensável para o panorama da ciência biológica e de melhoramento”, afirma o pesquisador. Atualmente, porém, estes bancos de dados têm apenas aumentado o volume e a complexidade de dados relevantes em Biologia, que tem se expandido muito rapidamente. 

Desta forma, segundo Dornelas, tornam-se necessários novos bancos de dados, com uma visão mais simplificada, mais fácil para o usuário utilizar, que os torne mais acessíveis ao usuário não especialista, como os profissionais que não trabalham especificamente com Genômica, mas que podem ser melhoristas, ou outros profissionais que usam com estes dados. 

Algumas centenas de milhares de genes de plantas já foram seqüenciados e, ao comparar os dados, os pesquisadores vêm percebendo que as seqüências das plantas são muito parecidas. Assim, ao invés de fazer seqüenciamentos de novos genomas de plantas, em alguns casos pode ser mais viável utilizar genes que já são conhecidos para outras plantas e o usá-los como se fossem o gene da planta com a qual se está trabalhando. O pesquisador pode utilizar as seqüências que já foram feitas para buscar especificamente o que quiser. Desta forma, estará adiantando um trabalho que levaria anos até o seqüenciamento da planta e a seleção do que realmente interessa para pesquisa. 

O banco de dados estará disponível em português e certamente em inglês. A previsão é de que em um ano este site já esteja funcionando plenamente. Provavelmente antes desse prazo já haverá uma versão preliminar para testes. A primeira iniciativa deste projeto foi instalar o site do Núcleo de Pesquisas Genômicas em Espécies Florestais no Ipef On-Line. 

O núcleo é um instituto virtual de divulgação de informação e pesquisas na área de genômica envolvendo espécies florestais no Brasil e no Mundo. Uma biblioteca virtual está à disposição dos usuários e contém artigos publicados e textos inéditos e exclusivos sobre genômica em geral e sobre genômica aplicada à espécies vegetais de interesse florestal. Além disso, diversos vínculos levam o usuário a outras páginas da Internet relacionadas à genômica.